Code Reference

• Density Profiling
  • Classes for Density Profiling
    • DensProfsBase
      • DensProfsBase.__init__()
      • DensProfsBase.estConcentrations()
      • DensProfsBase.estDensProfs()
      • DensProfsBase.fitDensProfs()
      • DensProfsBase.getIdxCat()
      • DensProfsBase.getMassesCenters()
      • DensProfsBase.getObjInfo()
      • DensProfsBase.getR200()
      • DensProfsBase.getXYZMasses()
      • DensProfsBase.plotDensProfs()
    • DensProfsGadget
  • Density profile estimation algorithms
    • calcDensProfsEllDirectBinning()
    • calcDensProfsKernelBased()
    • calcDensProfsSphDirectBinning()
    • calcMassesCenters()
  • Density profile fitting and plotting
    • drawDensProfs()
    • fitDensProf()
    • fitDensProfHelper()
    • getAlphaBetaGammaProf()
    • getEinastoProf()
    • getHernquistProf()
    • getNFWProf()
• Shape Profiling
  • Classes for Shape Profiling
    • DensShapeProfs
      • DensShapeProfs.__init__()
    • DensShapeProfsBase
      • DensShapeProfsBase.__init__()
      • DensShapeProfsBase.dumpShapeCatGlobal()
      • DensShapeProfsBase.dumpShapeCatLocal()
      • DensShapeProfsBase.getShapeCatGlobal()
      • DensShapeProfsBase.getShapeCatLocal()
      • DensShapeProfsBase.plotGlobalEpsHist()
      • DensShapeProfsBase.plotGlobalTHist()
      • DensShapeProfsBase.plotLocalEpsHist()
      • DensShapeProfsBase.plotLocalTHist()
      • DensShapeProfsBase.plotShapeProfs()
      • DensShapeProfsBase.vizGlobalShapes()
      • DensShapeProfsBase.vizLocalShapes()
    • DensShapeProfsGadget
      • DensShapeProfsGadget.__init__()
      • DensShapeProfsGadget.dumpShapeVelCatGlobal()
      • DensShapeProfsGadget.dumpShapeVelCatLocal()
      • DensShapeProfsGadget.getHeader()
      • DensShapeProfsGadget.getIdxCat()
      • DensShapeProfsGadget.getObjInfoGadget()
      • DensShapeProfsGadget.getR200()
      • DensShapeProfsGadget.getShapeCatVelGlobal()
      • DensShapeProfsGadget.getShapeCatVelLocal()
      • DensShapeProfsGadget.getVelXYZ()
      • DensShapeProfsGadget.getXYZMasses()
  • Shape profile estimation algorithms
    • calcMorphGlobal()
    • calcMorphGlobalVelDisp()
    • calcMorphLocal()
    • calcMorphLocalVelDisp()
  • Shape profiling tools
    • getEpsilon()
    • getGlobalEpsHist()
    • getGlobalTHist()
    • getLocalEpsHist()
    • getLocalTHist()
    • getShape()
    • getShapeMs()
    • getShapeProfs()
• Gadget-HDF5 Functions
  • CSH and galaxy catalogue generation
    • calcCSHIdxs()
    • calcObjCat()
  • HDF5 data extraction
    • getFoFSHData()
    • getPartType()
• Mock Universe and Mock Halo Functions
  • Mock universe generator
    • createLogNormUni()
  • Mock halo generator
    • genHalo()
• Common Functionalities
  • Base Profiling Class
    • CosmicBase
      • CosmicBase.__init__()
      • CosmicBase.estDensProfs()
  • Cosmo Tools
    • KSTest()
    • M_split()
    • calcMode()
    • chiSquareToICore()
    • chiSquareToIMultiDim()
    • chiSquareToIShapeCurve()
    • getBlocks()
    • getMeanOrMedianAndError()
    • respectPBC()
  • Python Routines
    • calcCoM()
    • calcMode()
    • checkDensFitMethod()
    • checkKatzConfig()
    • drawUniformFromEllipsoid()
    • drawUniformFromShell()
    • eTo10()
    • fibonacci_ellipsoid()
    • fibonacci_sphere()
    • getCatWithinFracR200()
    • getDelta()
    • getMassDMParticle()
    • getRhoCrit()
    • getSubSetIdxCat()
    • inShell()
    • isValidSelection()
    • print_status()
    • recentreObject()
    • respectPBCNoRef()
    • set_axes_equal()
  • Caching Routines
    • LMVLabel()
    • LengthInToInternal()
    • LengthInternalToOut()
    • MassInToInternal()
    • MassInternalToOut()
    • VelInToInternal()
    • VelInternalToOut()
    • getAdmissibleLMV()
    • getLMVInternal()
    • initialize()
    • updateCachingMaxGBs()
    • updateCachingMaxSize()
    • updateInUnitSystem()
    • updateOutUnitSystem()
• Cython Helper Functions
  • CythonHelpers
    • CythonHelpers.ZHEEVR()
    • CythonHelpers.calcCoM()
    • CythonHelpers.calcDensProfBruteForceEll()
    • CythonHelpers.calcDensProfBruteForceSph()
    • CythonHelpers.calcKTilde()
    • CythonHelpers.calcLocalSpread()
    • CythonHelpers.calcMenclsBruteForceEll()
    • CythonHelpers.calcMenclsBruteForceSph()
    • CythonHelpers.calcShapeTensor()
    • CythonHelpers.cython_abs()
    • CythonHelpers.respectPBCNoRef()